Il progetto disegnato da Leonardo è costituito da due parti: un’imbarcazione tradizionale e il sottomarino ad essa collegato tramite delle funi.

Il pilota poteva accedere al sommergibile attraverso una botola, indossando degli occhialini per la visione subacquea e respirando attraverso un tubo collegato ai galleggianti che, oltre a fungere da stabilizzatori, garantivano un certo approvvigionamento di aria.

Non era una macchina a tenuta stagna come i moderni sommergibili, ma poteva comunque muoversi agevolmente grazie a un congegno collegato a delle pinne e alimentato dalla forza del pilota.

Il sottomarino era un sistema di sabotaggio, il cui scopo era quello di permettere al suo pilota di avvicinarsi di nascosto alla nave avversaria e procurare una falla, grazie a uno strumento simile a una trivella a mano.